NMSA230 - Softwarové prostředky pro matematiku a stochastiku Zimný semester 2018/2019 | Cvičenie 5 | Ut 18/12/18 LaTeX & BibTeX Program piatého cvičenia NMSA 230 Práca s literatúrou a zoznamom literatúry v LaTeX-u a BibTeX-u. Odkazovanie na literárne zdroje a príprava vlastného súboru s potrebnou literatúrou. Základy vytvárania jednoduchých LaTeX-ových prezentácii pomocou beameru a konferenčných posterov (aspoň stručne). Užitočné materiály pre prácu s LaTeX-om Tobias Oetiker a kol.: Ne příliš stručný úvod do systému LaTeX 2ε. (PDF súbor) Kolektív AF UPOL: Drsný úvod do LaTeX-u. (PDF súbor) Warbrick, J.: Essential LaTeX ++ (PDF súbor) Olšák, P.: Typografický systém TeX, Konvoj, 1995. Knuth, D.: Computer and Typesetting Series, Vol. A: The TeX Book, Addison Wesley, 1986. Knuth, D.: Computer and Typesetting Series, Vol. B: TeX The Program, Addison Wesley, 1986. K doplneniu informácii obsiahnutých na tejto webovej stránke je možné využiť aj tento PDF dokument vytvorený v LaTeX-u. (k stiahnutiu aj zdrojový kod v kódovaní cp1250 a tiež zdrojový kód v kódovaní utf8) 1. BibTeX BibTeX je softwarový nástroj štandardne používaný s LaTeX-om a je určený k vytváraniu, spravovaniu a správnemu formátovaniu bibliografických záznamov vo finálnom PDF dokumente/reporte/texte. K správnemu fungovaniu vyžaduje BibTeX na vstupe tri samostatne súbory, na základe ktorých následne (pri prvej kompilácii() vytvorí potrebný podkladový súbor pre LaTeX: súbor aux, ktorý je vytvorený ako medzikrok pri tvorbe PDF dokumentu v LaTeX-u; súbor bst, ktorý definuje konkrétny štýl formátovania bibliografických zázanamov vo finálnom texte; súbor bib, ktorý obsahuje databázu bibliografických záznamov, z ktorých niektoré (nie nutne všetky) sa používajú v texte; Uživateľom vytváraný a dodávaný súbor je iba bib súbor s potrebným bibliografickým zoznamom. Ten je tvorený špecificky formátovaným textom, ktorý obsahuje všetky nutné bibliografické informácie k danej publikácii (napr. vedecký članok, kniha, softwar, alebo aj konkrétna webová stránka). Názorná ukážka súboru súbor bib je tu). Všimnite si, že jednotlivé záznamy majů podobnú štruktúru ako nasledujúce dve (prvá ukážka je pre knižnú publikáciu, druhá je pre odborný článok vo vedeckom časopise): @BOOK{Andel07, title = {Základy matematické statistiky}, publisher = {Matfyzpress}, year = {2007}, author = {Anděl, Jiří}, address = {Praha}, series = {Druhé opravené vydání}, isbn = {80-7378-001-1} } prípadne @ARTICLE{Cox72, author = {Cox, David R.}, title = {Regression Models and Life-Tables (with {D}iscussion)}, journal = {Journal of the Royal Statistical Society, Series B}, year = {1972}, volume = {34}, pages = {187--220}, number = {2} } Základný rozdiel vo vyššie uvedených príkladoch je ten, že prvý zdroj cituje publikáciu (knihu) a druhý cituje časť knižky, resp. článok. BibTeX teda rozoznáva konkrétny typ záznamu, s ktorým pracuje a podľa toho prispôsobi požiadavky a potrebné informácie, ktoré je potrebné z bibliografickom zázname špecifikovať (napr. pre článok nie je potrebne uvádzať vydávateľa, tzv. ‘publisher’, alebo opačne, v prípade knižneho záznamu – nie je nutné špecifikovať rozsah strán). Okrem typov article a book rozoznáva BibTeX aj iné typy literatúry: booklet, conference, inbook, manual, proceedings, inproceedings, misc, phdthesis, unpublished a prípadne ďalšie. Kompletný zoznam možnosti spolu s príkladmi a dalšími podrobnosťami je na tejto stránke: https://en.wikipedia.org/wiki/BibTeX. BibTeX funguje následovne: v LaTeX-ovom zdrojovom kóde na miestach, kde chceme citovať konkrétný literárny zdroj, použijeme príkaz \cite{} (prípadne iné modifikácie ako \citep{} alebo \citet{}). Ďalšie podrobnosti (hlavne o balíčku natbib) na tejto stránke: http://merkel.texture.rocks/Latex/natbib.php pri kompilácii zdrojového kódu LaTeX-om sa vytvorí súbor aux (podívajte sa do pracovného adresáru a nájdite príslušný súbor a nahledněte doň). V tomto aux súbore vyhľadá BibTeX miesta s výskytom citáci a tieto miesta nahradí vhodným kódom, ktorý presne špecifikuje požadované formátovanie v záverečnom zozname literatúry (spôsob formátovania je špecifikovaný v súbore bst). následne opäť LaTeX-om zkompilujeme zdrojový kód – na miestach s citáciami sa objaví požadovaný odkaz na literatúru a na záver článku bude vytlačený zoznam citovanej literatúry (v presne požadovanom tvare). Základnou výhodou je, že pri použití viacerých literárnych zdrojov je ich zoznam automaticky vytlačený na záver dokumentu a to v konzistentnom tvare, v presne požadovanej forme. v prípade, že chceme v zozname literatúry uviesť aj článok, ktorý v samotnom texte necitujeme (v mnohých odborných publikáciach a vedeckých článkoch to je ale explicitne zakázané), je potrebné použiť príkaz \nocite{}. Užitočné Jednoduchá ukážka na prácu s BibTeX-om je napríklad tu: LaTeX03.tex. K dispozícii je súbor s databázou bibliografických záznamov (súbor literatura.bib) a tiež súbor základných štýlov pre český jazyk (súbor czplainnat.bst). K dispozícii sú mnohé iné štýly, napr. plainnat.bst, alebo chicago.bst. Podrobný zoznam bibliografických štýlov spolu s ukážkami a vysvetlením, ako fungujú, je k dispozícii na stránke https://www.overleaf.com/learn/latex/Bibtex_bibliography_styles Pri písaní odborného textu v ktorom sa nachádzajú rôzne literárne zdroje sa zvykne v záverečnom zozname literatúry uvadzať pouze taký zdroj, ktorý je v samotnom dokumente/texte explicitne spomínaný (v prípade nutnosti zahrnúť do zoznamu literatúry aj zdroj, na ktorý sa v texte explictne neodkazuje, je potrebné použíť príkaz \nocite{}). Najlepším riešením (a v mnohých renomovaných časopisoch zároven aj jediným) je explicitne citovať všetky zdroje uvedené v zozname literatúry. 2. Beamer prezentácia Pomocou LaTeX-u je možné vytvárať aj efektné PDF prezentácie (od jednoduchých štýlov a templatov, až po komplexné a náročné prezentácie, vyžadujúce nemalu mieru programovacích zručnosti). Typ dokumentu (document class), ktorý umožnuje vytvárať prezentácie, sa nazýva beamer a obsahuje celú řadu různych funkcií a makier, ktoré sú pre tvorbu prezentácii ideálne. Formátovanie samotného textu a matematických výrazov je analogické, ako pri vytváraní klasického PDF dokumentu (napr. typ article, book, paper, a podobne). Okrem toho je dobré poznať a používať aj dalšie užitočné makrá a preddefinovaé funkcie. Prezentácia v LaTeX-u teda začína následovne: \documentclass{beamer} a jednotlivé transparencie (slidy) sú vždy definované pomocou párových príkazov \begin{frame} ... obsah jednej transparencie ... \end{frame} Jednoduchá (pouze titulná strana) prezentácia vytvorená v LaTeX-u by mohla vyzerať napr. takto: \documentclass{beamer} \usetheme{Boadilla} \title{My Presentation} \subtitle{Using Beamer} \author{Joe Bloggs} \institute{University of ShareLaTeX} \date{\today} \begin{document} \begin{frame} \titlepage \end{frame} \end{document} Vyššie uvedený zdrojový kód je samozrejme nutné zkompilovať pomocou PDF-LaTeX-u. Po kompilácii bude výsledná prezentácia dostupná ako PDF súbor v príslušnom pracovnom adresári. Užitočné V Beameru je k dispozícii celá řada různych tématických templatů - väčšinou sú nazvané podľa svetových miest (napr. Pittsburgh, Rochester, Singapore, atď). Zoznam (nie nutne kompletný) je na stránke http://deic.uab.es/~iblanes/beamer_gallery/index_by_theme.html. Beamer taktiež využív rôzne farebné nastavenia, ktoré sa definujú taktiež v preambule. Defaultné možnosti sú označené napr. názvami rôznych zvierat (napr. seagull, seahorse, whale a pod.) a zoznam (nie nutne kompletný) je na napr. na stránke http://deic.uab.es/~iblanes/beamer_gallery/index_by_color.html. Rôzne kombinácie štýlu a farby: http://deic.uab.es/~iblanes/beamer_gallery/index_by_theme_and_color.html. Okrem toho je samozrejme možné definovať vlastne štýly, farby a ich rôzne kombinácie. Mnoho ďalších prezentačných templetov pre beamer a LaTeX sa dá nájsť na internete. 3. Konferenčný poster Pomocou LaTeX-u je možné jednoducho (a s použitím analogických príkazov, ako pri štandardnom PDF dokumente, alebo aj Beamer prezentácii) vytvoriť aj konferenčný poster. K dispozícii je opäť množstvo rôzných formátov a štruktúr, ktoré sa dajú nájsť na internete. Základný súbor makier a príkazov je napr. v dokumente typu tikzposter, t.j., poster vytváraný v LaTeX-u by mal začínať následovne: \documentclass[24pt, a0paper, portrait]{tikzposter} \usepackage[utf8]{inputenc} \title{Tikz Poster Example} \author{ShareLaTeX Team} \date{\today} \institute{ShareLaTeX Institute} \usetheme{Board} \begin{document} \maketitle \end{document} Používať sa ale dá aj samotný beamer štýl. Niekoľko jednoduchých príkladov a vzorových templatov je k na stránke https://www.sharelatex.com/learn/Posters, ale na internete sa dajú nájsť volne dostupne a omnoho zaujímavejšie verzie. O niečo zaujimavejšie a komplexnejšie príklady (s možnosťou priamého stiahnutia a následného použitia) sú na tejto stránke: https://www.latextemplates.com/cat/conference-posters. Domáca úloha (to be finally submitted) (Deadline: 6. cvičenie | Pa.11.01.2019 | konec semestru) PDF report, ktorý ste doteraz vypracovali, postupne doplňte o následujúce: Vytvorte si vlastnú (aspo stručnú) databázu bibliografických záznamov, kde budete mať minimálne tri rôzne typy záznamov (napr. article, book, misc, a pod.). Váš PDF report doplňte o krátky (zmysluplný text) v ktorom budete citovať aspoň tri literárne zdroje z vyššie vytvorenej biblio-databázy. Zoznam literatúry na konci textu doplňte aspoň o dva ďalšie zdroje, ktoré v texte síce explicitne necitujete, ale chcete ich mať v zozname literatúry uvedené. Výsledný PDF súbor, ktorý bude obsahovať všetky jednotlivé časti zadávané jako domáce úlohy v priebehu semetra, pomenujte prijmeni_jmeno.pdf a následne ho odošlite emailom na adresu maciak AT karlin.mff.cuni.cz, najneskôrdo konca semestru, t.j. 11.01.2019.